Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
HOXA13P31271 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms