Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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