Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CIPCQ9C0C6 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CIPCQ9C0C6 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CIPCQ9C0C6 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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