Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PTF1AQ7RTS3 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PTF1AQ7RTS3 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTF1AQ7RTS3 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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