Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL132855.1-201ENST00000557368 207 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC027688.1-201ENST00000568471 584 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MIR3918-201ENST00000581555 93 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MIR3194-201ENST00000582236 73 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC026150.3-201ENST00000602595 499 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GZMB-209ENST00000616551 559 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC099811.5-201ENST00000617211 819 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC244472.5-201ENST00000619103 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 C20orf78-202ENST00000623418 606 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC01002-216ENST00000632351 572 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SNORA14B-201ENST00000384452 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GAS8-AS1-201ENST00000408886 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 HSD3BP5-201ENST00000434856 1132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC092431.2-201ENST00000441658 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC073346.1-201ENST00000441928 651 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 HSD3BP4-201ENST00000511509 1120 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC02021-203ENST00000514145 569 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LMO3-222ENST00000540445 906 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 TP53TG3HP-201ENST00000563487 346 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 SLC25A6P5-202ENST00000602729 1038 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL596094.1-201ENST00000608273 276 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC004678.1-201ENST00000615016 929 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 RN7SL301P-202ENST00000618767 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ANKRD39Q53RE8 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.6 ms