Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms