Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms