Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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HERC1Q15751 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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HERC1Q15751 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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HERC1Q15751 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNF152-201ENST00000312828 9501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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