Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NBR1Q14596 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms