| RUNX3 | Q13761 | TCEAL7-202 | ENST00000372666 | 852 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAJ4-201 | ENST00000390533 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PDC-201 | ENST00000391997 | 1242 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC233289.1-201 | ENST00000403700 | 508 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSPE1P12-201 | ENST00000412576 | 301 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TCEA1P4-201 | ENST00000415066 | 844 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00867-202 | ENST00000415417 | 488 nt | TSL 3 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RMDN2-207 | ENST00000417700 | 1426 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161631.1-201 | ENST00000417933 | 486 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL451062.2-201 | ENST00000427515 | 271 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01208-202 | ENST00000434969 | 827 nt | TSL 2 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SRRM1-203 | ENST00000447431 | 3691 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS27AP15-201 | ENST00000447672 | 466 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCRL1P1-201 | ENST00000449542 | 1053 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NREP-207 | ENST00000450761 | 636 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087071.2-201 | ENST00000483283 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PDCD10-216 | ENST00000492396 | 814 nt | TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112206.2-204 | ENST00000504068 | 793 nt | TSL 3 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108157.1-201 | ENST00000510511 | 539 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP360-201 | ENST00000516555 | 118 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090151.1-201 | ENST00000520784 | 730 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYCSP28-201 | ENST00000534284 | 321 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02451-202 | ENST00000548764 | 579 nt | TSL 4 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC020891.1-201 | ENST00000558785 | 174 nt | TSL 3 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSPE1P5-201 | ENST00000561489 | 272 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND2P13-201 | ENST00000577438 | 1039 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR5685-201 | ENST00000579080 | 79 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS4XP16-203 | ENST00000596904 | 698 nt | TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIMT1-201 | ENST00000597105 | 1050 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL022238.2-202 | ENST00000607915 | 658 nt | TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL391262.2-201 | ENST00000622466 | 494 nt | BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM26D-205 | ENST00000628083 | 1117 nt | TSL 2 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNTN5-212 | ENST00000619298 | 5734 nt | TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MECOM-219 | ENST00000628990 | 4835 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TCHHL1-201 | ENST00000368806 | 3603 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TCF4-281 | ENST00000636822 | 7640 nt | TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2AP1-202 | ENST00000641114 | 1548 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UGT2B17-201 | ENST00000317746 | 2077 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TES-202 | ENST00000393481 | 2763 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC084357.3-201 | ENST00000541353 | 2751 nt | TSL 5 BASIC | 4.25 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WAC-221 | ENST00000628285 | 2740 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BMPR2-201 | ENST00000374574 | 9683 nt | TSL 2 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RANBP3L-201 | ENST00000296604 | 3104 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EED-206 | ENST00000527888 | 1422 nt | TSL 2 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AJ009632.2-204 | ENST00000635621 | 1401 nt | TSL 5 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC128685.1-201 | ENST00000490357 | 1834 nt | TSL 5 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016588.2-201 | ENST00000632484 | 3021 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RBMS3-205 | ENST00000434693 | 8540 nt | TSL 5 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01881-201 | ENST00000416103 | 412 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC013410.2-201 | ENST00000422627 | 201 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC003659.1-201 | ENST00000424251 | 465 nt | TSL 5 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNF19BPX-201 | ENST00000426224 | 625 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL691449.1-201 | ENST00000426570 | 421 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GYPE-202 | ENST00000437468 | 499 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SDR42E1P3-201 | ENST00000438345 | 502 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006011.1-201 | ENST00000442758 | 349 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7L1P1-201 | ENST00000448259 | 785 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353718.1-201 | ENST00000451028 | 517 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF2S2P4-201 | ENST00000461070 | 984 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P1-201 | ENST00000468161 | 747 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P9-201 | ENST00000468715 | 747 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CMAHP-205 | ENST00000471416 | 1118 nt | TSL 2 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLGLA-202 | ENST00000482249 | 475 nt | TSL 3 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SUCLG2-AS1-203 | ENST00000496640 | 862 nt | TSL 5 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BNIP3P41-201 | ENST00000503774 | 571 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WWC2-AS1-201 | ENST00000511846 | 404 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138938.1-201 | ENST00000515431 | 782 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018682.2-201 | ENST00000517716 | 399 nt | TSL 5 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090193.1-201 | ENST00000518633 | 543 nt | TSL 4 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM68-206 | ENST00000519784 | 1009 nt | TSL 3 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZFHX4-207 | ENST00000521891 | 14019 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC019227.1-201 | ENST00000526902 | 510 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNTN5-209 | ENST00000528682 | 3800 nt | APPRIS P4 TSL 5 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000873.2-205 | ENST00000529031 | 435 nt | TSL 2 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023442.3-203 | ENST00000530946 | 533 nt | TSL 4 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UTS2-201 | ENST00000054668 | 420 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139021.2-201 | ENST00000556390 | 399 nt | TSL 3 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC120057.2-201 | ENST00000571520 | 271 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC129492.2-201 | ENST00000577807 | 517 nt | TSL 3 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC053481.3-201 | ENST00000577881 | 843 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PDZPH1P-202 | ENST00000602846 | 722 nt | TSL 3 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MKKS-203 | ENST00000609375 | 882 nt | TSL 2 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023490.1-202 | ENST00000620909 | 820 nt | TSL 5 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112200.1-201 | ENST00000625015 | 234 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF067845.5-201 | ENST00000633906 | 437 nt | TSL 3 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EOGT-210 | ENST00000615922 | 1931 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EYA1-203 | ENST00000388740 | 3788 nt | TSL 5 BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM126B-202 | ENST00000418596 | 9333 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PHTF2-208 | ENST00000450574 | 2516 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EPHA3-202 | ENST00000452448 | 2546 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPN13-201 | ENST00000316707 | 7546 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006042.3-201 | ENST00000454684 | 1469 nt | BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ING3-205 | ENST00000445699 | 1723 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.24 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPAG17-201 | ENST00000336338 | 6924 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.23 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BCLAF1-207 | ENST00000527759 | 4373 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.23 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DOCK7-218 | ENST00000635123 | 6297 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.23 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ORC4-202 | ENST00000392857 | 6530 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.23 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010132.3-201 | ENST00000442788 | 2430 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 4.23 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004982.1-201 | ENST00000608770 | 1655 nt | TSL 4 BASIC | 4.23 | □□□□□ -1.73 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP22-201 | ENST00000365393 | 109 nt | BASIC | 4.23 | □□□□□ -1.73 | | |