Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RUNX3Q13761 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms