Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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