Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NME3Q13232 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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NME3Q13232 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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