Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
IFT88Q13099 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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