Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms