Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NEDD8-MDP1E9PL57 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms