Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms