Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms