Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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