Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms