Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1DQ9H5J8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1DQ9H5J8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms