Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms