Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda2Q9CRC9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms