Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTDSS2Q9BVG9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms