Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD1Q99460 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms