Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAMKK2Q96RR4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKK2Q96RR4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms