Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms