Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DCHS1Q96JQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms