Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTBP4Q8N2S1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms