Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTF1AQ7RTS3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms