Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL24A1Q17RW2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL24A1Q17RW2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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