Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDB1Q16531 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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