Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK5Q16478 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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