Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSPNQ14714 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSPNQ14714 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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