Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA1SQ13698 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1SQ13698 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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