Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3FQ13275 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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SEMA3FQ13275 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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SEMA3FQ13275 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA3FQ13275 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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