Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM28Q13263 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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