Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP1-1Q07627 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms