Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XPCQ01831 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPCQ01831 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPCQ01831 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPCQ01831 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPCQ01831 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPCQ01831 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XPCQ01831 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
XPCQ01831 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
XPCQ01831 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
XPCQ01831 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
XPCQ01831 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPCQ01831 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPCQ01831 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPCQ01831 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPCQ01831 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPCQ01831 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
XPCQ01831 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
XPCQ01831 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPCQ01831 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPCQ01831 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
XPCQ01831 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPCQ01831 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPCQ01831 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPCQ01831 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms