Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RELNP78509 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RELNP78509 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RELNP78509 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELNP78509 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELNP78509 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RELNP78509 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELNP78509 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms