Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK1P57059 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK1P57059 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK1P57059 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK1P57059 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK1P57059 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK1P57059 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK1P57059 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK1P57059 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK1P57059 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK1P57059 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK1P57059 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK1P57059 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIK1P57059 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIK1P57059 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIK1P57059 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIK1P57059 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIK1P57059 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK1P57059 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK1P57059 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK1P57059 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms