Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms