Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATN1P54259 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATN1P54259 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATN1P54259 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATN1P54259 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATN1P54259 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATN1P54259 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATN1P54259 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATN1P54259 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATN1P54259 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATN1P54259 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms