Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KPNA1P52294 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KPNA1P52294 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms