Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms