Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5C1P36542 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5C1P36542 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms