Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNB1P35222 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTNNB1P35222 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms