Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNA6P17658 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNA6P17658 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms