Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSPP15924 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSPP15924 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSPP15924 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSPP15924 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSPP15924 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms