Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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