Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP10AO60312 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP10AO60312 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms